帕特丽夏 索托·贝塞拉,文学学士,博士

副教授

物理

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物理
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帕特丽夏 索托·贝塞拉,文学学士,博士

副教授

物理

帕特丽夏在哥伦比亚波哥大长大,在那里她获得了物理学学士和硕士学位 洛斯安第斯大学.  然后她参加了 格罗宁根大学她在荷兰格罗宁根获得数学和自然科学博士学位. 2004年,她搬到了 加州大学圣巴巴拉分校 进行博士后培训, 部分经费由美国大学妇女协会提供的国际奖学金提供. 帕特丽夏于2007年8月加入皇冠体育博彩大学物理系. 她的科学专长属于广义的计算分子生物物理学领域,旨在破译神经退行性疾病标志蛋白和肽病理折叠过程的生物物理原理, 比如阿尔茨海默氏症和朊病毒病.  帕特丽夏的学术目的是在综合研究和教育计划中与本科生建立物理和生命科学的桥梁.
 

研究的焦点

科学主题:蛋白质构象动力学,病理蛋白质折叠. 技术:计算统计力学, 结构生物信息学, 生物分子建模, 分子动力学模拟, 分子对接, 正态分析, 连续静电学

部门

物理

位置

副教授

文章

  • 核酸研究
    Glanzer J. G.卡恩斯,K. A.,索托,帕特里夏,刘,S.帕克赫斯特,L. J.奥克利,G. G. 一个小分子直接抑制p53反式活化结构域与复制蛋白A的结合
    41, p. 2047-2059 2013
  • 美国化学学会杂志
    格拉贝诺尔,梅根,吴,春,索托,帕特里夏,谢伊,琼-艾玛,鲍尔斯,迈克尔·T. 朊病毒蛋白片段106-126的低聚物可能由 ?-发夹溶液, 蛋氨酸氧化抑制组装而不改变肽的单体构象
    132, p. 532-539 2010
  • 磁共振杂志
    布兰登·阿姆斯特朗.索托,帕特丽夏谢伊,Joan-Emma, 汉, 利用吡啶和哌啶环氮氧自由基进行核动态极化和分子动力学模拟
    200, p. 137-141 2009
  • 物理生物学
    索托,帕特里夏,朱伊特,A.庄,Z.谢伊,J. E. 表面系缚对src-SH3蛋白结构域折叠的影响
    6, p. 17页2009
  • J. Am. 化学. Soc.
    克朗,M. G.,华,李.索托,P.周,R.伯尔尼,B. J.谢伊,J. -. 水在阿尔茨海默病淀粉样蛋白- β ABeta16-22原丝组装中的作用
    130, p. 11066-11072 2008
  • 生物物理期刊
    索托,P.格里芬,M。. A.谢伊,J. -. n -甲基化肽抑制阿尔茨海默病淀粉样蛋白- β纤维生成机制的新见解
    93, p. 3015-3025 2007
  • 化学物理杂志
    帕特里夏·索托,巴鲁姆克特纳,A., Joan-Emma,疏水环境中聚丙氨酸的乳木果聚集
    124, p. 134904 2006

演讲

  • Robyn Scott, Carla Barrera, 威廉贪污, Ronald Shikiya和帕特里夏·索托. 朊病毒蛋白残基接触的动态影响跨物种传播屏障. INBRE会议,内布拉斯加州,2016
  • 认知包装:学习如何学习物理, 在物理教育研究会议和美国物理教师协会上发表, 夏季会议, 萨克拉门托, CA. 2016
  • 查德·奈里,杰西·吴和帕特丽夏·索托. 细胞膜环境下细胞朊蛋白PrPc与胆固醇分子的相互作用. St. 皇冠体育博彩大学的阿尔伯特日. 2016
  • Hamada, Robyn; Woo, Jesse; Shikiya, Ronald; 索托, 帕特丽夏. 细胞朊病毒蛋白的比较构象动力学以阐明物种屏障. 第60届生物物理学会会议,洛杉矶,加州2016
  • Woo, Jesse; Nieri, Chad; Gonzales, Roger; 巴茨, Jason; 索托, 帕特丽夏. 朊病毒蛋白在膜界面的构象动力学. 第60届生物物理学会会议,洛杉矶,加州2016
  • “作为科学实验的课程改造”. 第60届生物物理学会会议. 2016
  • 性别是否影响大学本科生研究的文献计量学? NSF advance ASAP会议,西雅图,WA. 合作者:Birgit Mellis, crystal Bruce, Graciela Lacueva, Anne M. 2015年威尔逊
  • 帕特里夏·索托,《皇冠体育》. 全校评核日. 2015
  • Hamada, Robyn; Lax, Angela; Woo, Jesse; Shikiya, Ron and 索托, 帕特丽夏. 朊病毒蛋白的结构能解释哺乳动物之间的传播屏障吗? INBRE会议,林肯,2015
  • 帕特里夏·索托, Michael Cherney, Gintaras Duda, David L. Sidebottom. 在以文科为主的本科院校(PUI)进行生命科学导论物理(IPLS)课程的改造. 2015年美国物理教师协会夏季会议,马里兰大学帕克分校
  • 帕特里夏·索托, 娜塔莉中方, 玛格丽特•卡特, 罗杰·冈萨雷斯, 威廉贪污, 安吉拉松懈, 乍得Nieri, 赵博和Jason C. 巴茨. 细胞朊病毒蛋白的构象动力学. 神经朊病毒2015,科罗拉多州立大学,柯林斯堡,科罗拉多州. 2015
  • 帕特里夏·索托, 马特时常要, 威廉贪污, 罗杰·冈萨雷斯, 乍得Nieri, Bo Zhao和Jason C. 巴茨. 朊蛋白及其与模型膜相互作用机制. 生物物理学会会议,2015
  • 与研究生赵波共同主讲人探讨了两种mustelids的朊病毒蛋白的细胞构象动力学对物种屏障效应的贡献. 2014研究展览会
  • 与研究生Brendy青木共同主讲合成Ab原丝的分子建模, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2014
  • 与研究生Charlie Nguyen共同主讲细胞朊病毒蛋白构象动力学的分子模型, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2014
  • 与研究生Brendy青木共同主讲合成Ab原丝的分子建模. St. 2014年,皇冠体育博彩大学,阿尔伯特的一天
  • 与研究生Charlie Nguyen共同主持, 伊恩冷和Jason 巴茨关于细胞朊蛋白构象动力学的分子模型. St. 阿尔伯特的日子,皇冠体育博彩大学. 2014
  • 与研究学生威廉贪污, 伊恩冷, 查尔斯·阮, Shannon L. Bartely-Hunt和Jason 巴茨关于细胞朊病毒蛋白构象动力学的分子模型. St. 2014年,皇冠体育博彩大学,阿尔伯特的一天
  • 与研究生马特时常要共同主持, 内森·霍斯特, Brendy青木和Saad Malik关于淀粉样蛋白在水界面的构象动力学. St. 2014年皇冠体育博彩大学阿尔伯特节
  • 与研究生Brendy青木共同主讲合成Ab原丝的分子模型. ACS会议,达拉斯,德州2014
  • 与研究生Charlie Nguyen共同主持, 伊恩冷和Jason 巴茨关于细胞朊蛋白构象动力学的分子模型. APS会议,丹佛,2014
  • 2013年诺贝尔计算分子生物物理学奖, 物理系, 皇冠体育博彩大学2014年
  • 与研究生威廉贪污共同主持, 伊恩冷, 查尔斯·阮, 和合作者Shannon L. Bartely-Hunt和Jason 巴茨关于细胞朊病毒蛋白构象动力学的分子模型. 朊病毒地平线会议,柯林斯堡,2013年
  • 蛋白质折叠和聚集的层次模型, 内布拉斯加州奥马哈大学物理系2013年毕业
  • 蛋白质-表面相互作用的分子建模,2013年美国科罗拉多大学BMS研讨会
  • 与研究生马特时常要共同主持, 内森·霍斯特, Brendy青木和Saad Malik关于淀粉样蛋白在水界面的构象动力学. UNMC结构生物学研讨会. 2013
  • 与研究生内森·霍斯特共同主持, 马特时常要, Brendy青木, William Marquardt关于淀粉样蛋白在水界面的构象动力学. 2013年荣誉日
  • 与硕士生马特时常要共同主持, William Marquardt关于磷脂双层的计算自组装, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2013
  • 与本科生内森·霍斯特和Brendy青木共同主持, 和硕士生马特时常要关于Ab阿尔茨海默氏原丝与脂质双分子层相互作用的粗粒分子动力学分析, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2013
  • 与研究生Saad Malik共同主讲人关于叙利亚仓鼠朊病毒蛋白与模型脂质双分子层相互作用时的构象动力学, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, Ne 2013
  • 与研究生查尔斯·阮共同主持, 道尔顿伯克, Graft和Jason 巴茨会讨论淀粉样蛋白的分子模型吗. St. 2013年阿尔伯特日
  • 与研究生马特时常要共同主持, 内森·霍斯特, Brendy青木和Saad Malik关于淀粉样蛋白在水界面的构象动力学. St. 阿尔贝二世亲王的一天. 2013
  • 与研究生马特时常要共同主持, 内森·霍斯特, Brendy青木和Saad Malik关于淀粉样蛋白在水界面的构象动力学. 2013年在巴尔的摩召开的APS会议
  • 与研究生内森·霍斯特在Ferlic研讨会上共同发表题为“Ab原丝与模型双层相互作用的粗粒模型”的演讲. 克雷顿大学,奥马哈,2012
  • 与研究生马特时常要共同主持, 内森·霍斯特, Brendy青木和Saad Malik在中西部地区ACS会议上关于“淀粉样蛋白在水界面的构象动力学”. ACS,奥马哈,东北2012
  • 与研究生马特时常要共同发表论文:通过正态分析计算,多态Ab原纤维具有明显的构象动力学, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2012
  • 与研究生伊恩冷共同主讲人关于AGAAAAGA与叙利亚仓鼠朊蛋白的结合模式, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2012
  • 2012年在北卡罗来纳大学林肯分校牙科学院奥克利研究小组受邀演讲
  • 与研究生Brendy青木共同主持, 伊恩冷, 内森·霍斯特, 黛西Liberato, (lancaster沙, 萨曼莎Swerdferger, Jason 巴茨关于淀粉样蛋白的构象动力学. St. 2012年阿尔伯特日
  • 与研究生马特时常要共同发表论文:通过正态分析计算,多态淀粉样蛋白- b原丝具有明显的构象动力学. 2012年在马萨诸塞州波士顿举行的APS会议
  • 受邀在GAA/INBRE会议上发表演讲,奥马哈,2011
  • 应邀在2011年美国东北奥马哈举行的亚太经合组织夏季会议上发言
  • 与研究生马特时常要共同发表论文:通过正态分析计算,多态淀粉样蛋白-b原丝具有明显的构象动力学. 第四届结构生物学和分子生物物理学研讨会,奥马哈,美国东北大学
  • 与研究生Trang Doan共同发表关于阿尔茨海默病AB原纤维弹性的研究,采用全原子正常模式分析. 内布拉斯加州科学院,内布拉斯加州卫斯理大学,林肯,2011
  • 与研究生Tana Friesth共同发表关于AGAAAAGA肽的朊病毒抑制剂结合区域的鉴定和表征. 内布拉斯加州科学院,内布拉斯加州卫斯理大学,林肯,2011
  • 与研究生柯蒂斯·乔丹共同发表演讲,讨论在理解AB原纤维动力学中使用粗粒度正态分析. 内布拉斯加州科学院,内布拉斯加州卫斯理大学,林肯,2011
  • 2010年受邀在伊利诺斯州奥兰治市西北大学演讲
  • 与研究生Tana Friesth共同发表关于AFAAAAGA肽朊病毒抑制剂结合区域的鉴定和表征. Ferlic研讨会,皇冠体育博彩大学,奥马哈,2010
  • 与研究生Tana Freisth, Shannon L. 巴特尔-亨特和杰森C. 关于朊病毒蛋白及其与抑制剂和模型表面相互作用的机制. 第45届区域ACS会议于2010年堪萨斯州威奇托举行
  • 与研究学生Curtis Jordan共同发表关于自旋标签分子在水和脂质环境中的动力学, St. 阿尔伯特日,皇冠体育博彩大学,奥马哈,2010
  • 奥古斯塔纳学院,苏福尔斯,SD 2010特邀演讲
  • 与研究生Ben Soukup共同发表关于阿尔茨海默病b-淀粉样纤维模型的微观力学特性. 第54届生物物理会议,旧金山,加州. 2010
  • 2009年加州大学圣巴巴拉分校材料研究实验室IRG-1会议演讲
  • 内布拉斯加州科学院-内布拉斯加州卫斯理大学第118届年会上的主题演讲, 林肯, NE 2008
  • 与研究生珍妮·伯恩斯共同演讲“蛋白质纳米原纤维”, 内布拉斯加州科学院, 内布拉斯加州卫斯理大学, 林肯, NE 2008
  • 阿尔茨海默病治疗策略的博士后研究报告:淀粉样蛋白抑制剂的合理设计. 戈登蛋白质动力学研究会议,文图拉,加州,美国2008年1月8日至12日
  • 分子动力学模拟监测抑制剂抑制淀粉样蛋白原纤维生长机制的博士后研究报告. 第229届ACS全国会议,圣地亚哥,加州,美国2005年3月13日至17日
  • 不同化学环境下SIV肽聚集的博士研究报告. 蛋白质动力学戈登研究会议,文图拉,加州,美国1月11日至16日. 2004
  • 分子动力学模拟监测SIV p32融合肽单层原纤维稳定性的博士研究报告. 第四届佐治亚理工学院和佐治亚大学生物信息学国际会议. 计算机生物网络:从基因组学到流行病学,亚特兰大,GA,美国,11月13 -16日. 2003
  • 用分子动力学模拟表征b-发夹形成的体化学选择性的博士研究报告. 纳米科学与技术会议,荷兰格罗宁根,5月18 - 21日. 2003
  • 在生物群落年会上的博士研究报告, 伯格阿拉斯, Alf-Mosel, 德国关于SIV肽在不同化学环境下的聚集. 2003
  • 不同化学环境下SIV肽聚集的博士研究报告. 蛋白质研究小组会议,荷兰伦特伦. 2003
  • 用分子动力学模拟表征b-发夹形成的体化学选择性的博士研究报告. 欧洲第一原理会议的生物物理学:从电子学到中尺度, 圣费里乌德奎索斯, 西班牙, 9月7日- 12日. 2002
  • 关于Betanova及其突变体构象行为的系统分子动力学研究的博士研究报告. ESS研讨会:蛋白质的灵活性和功能,海德堡,德国,1月25日至27日. 2002
  • 在生物群落年会上的博士研究报告, 伯格阿拉斯, Alf-Mosel, 德国关于用分子动力学模拟表征b-发夹形成的体化学选择性2002
  • 用分子动力学模拟表征b-发夹形成的立体化学选择性的博士研究报告. 蛋白质研究小组会议,荷兰伦特伦. 2002
  • 一种三链反平行b片形成肽及其一些突变体的分子动力学研究的博士研究报告. SIMU项目“弥合时间尺度差距”会议,康斯坦茨,德国,9月10 -13日. 2001
  • 一种三链反平行b片形成肽及其一些突变体的分子动力学研究的博士研究报告. 第27届欧洲生化学会联合会FEBS会议. 葡萄牙里斯本,6月30日至7月5日. 2001
  • 一种三链反平行b片形成肽及其一些突变体的分子动力学研究的博士研究报告. 青年科学家论坛. 蛋白质结构、功能、运输和信号传导. 2001年6月28日至30日,葡萄牙,Oeiras, Quimica和生物研究所
  • 在生物群落年会上的博士研究报告, 伯格阿拉斯, Alf-Mosel, 2001年德国关于Betanova及其突变体的分子动力学研究
  • Betanova及其突变体构象行为的系统分子动力学研究的博士研究报告. 蛋白质研究小组会议,荷兰伦特伦. 2001
  • 在生物群落年会上的博士研究报告, 伯格阿拉斯, Alf-Mosel, 德国关于Betanova的分子动力学研究2000
  • 一种合成疟疾肽的分子模型的硕士研究报告. 第十三届IUPAB国际大会,印度新德里,9月19 - 24日. 1999
  • 熔化离子通道的分子模型. 全国物理学大会,麦德林,哥伦比亚,1997年6月

联邦

  • NSF-TUES. 生命科学物理学入门会议

  • 泰瑞格:3万小时的电脑时间.

状态

  • neepscor第一奖

其他

  • 克赖顿大学普通物理实验II PHY 206新课程Magis核心课程资助.

  • 皇冠体育博彩大学- CURAS教师奖学金2014

  • 2012- 2013年皇冠体育博彩大学乔治·哈迪克斯校长基金

  • 皇冠体育博彩大学2011年研究生院

  • 皇冠体育博彩大学乔治·哈迪克斯校长基金2015- 2016

  • 获得MAC旅行奖,参加第59届生物物理学会会议
    生物物理协会
  • 教师使命奖学金
    皇冠体育博彩大学文理学院